测序原理

　　Ion Torrent是最新一代的测序技术，它的问世给测序技术的应用带来了激动人心的进展。它采用了半导体技术和简单的化学试剂进行DNA测序，而不是使用光作为媒介。在半导体芯片的微孔中固定DNA链，随后依次掺入ATCG。随着每个碱基的掺入，释放出氢离子，在它们穿过每个孔底部时能被检测到，通过对H+的检测，实时判读碱基。

平台优势

1. 100X高深度测序提供更好的覆盖度，为您探索变异提供更多数据支持！

2. 包含建库，测序，数据质控，比对，SNP、InDel等变异检测，多达10个以上的数据库的注释服务。

3. 低至50ng的起始量，更加适合微量样品外显子的研究需求。

4. AmpliSeq™技术的力量能够在10×覆盖度时提供>94%高均匀度的碱基命中靶标率。

5. 可免费提供100+个SNP位点的验证，为测序和变异检出的准确性保驾护航。

技术流程

　　Ion AmpliSeq™ Exome RDY Kit适用于人类全外显子序列的富集，通过在外显子区域设计引物并进行 PCR扩增，构建测序文库，利用Ion Proton平台测序来实现人类全外显子测序。该Kit共设计了近294000对引物，并将引物干粉分装在96孔板上的12个孔位中，通过12个孔位同时的PCR可以实现1个全外显子文库的构建，相对芯片杂交捕获的外显子建库方法而言，该Kit仅需6小时即可完成文库的构建，人工操作约50min，建库样品起始量为50-100ng，是一种快速、简便、精确的全外显子文库构建方法。

　　Ion AmpliSeq™ Exome RDY Kit首先对样品DNA进行PCR反应，扩增得到外显子序列，再利用核酸外切酶消化扩增引物，得到的平末端产物与Proton 接头连接，Ampure XP磁珠纯化后即可得到测序文库。该文库通过qPCR定量后可用Ion Proton平台进行测序。

文库上机质控

　　我们会检测外显子文库片段大小，文库DNA的质量浓度合格，达到Ion Proton上机要求方可进行测序。

信息分析内容

　　包含标准信息分析和肿瘤高级分析，复杂疾病和单基因病高级分析。Proton配套的分析软件Ion Reporter™自动化分析系统能够通过自动化数据传输和分析来处理Proton测序仪的下机数据。针对单个样品、成对肿瘤-正常样品以及遗传性家系样品（trio样品）进行突变检测，变异检测内容包括SNP，InDel，CNV等。

单样品分析内容（标准分析）

　　下机数据QC

　　使用tamp进行数据比对

　　比对结果QC

　　SNPs、INDELs、CNV检测

　　SNPs、InDels和CNV数据库注释

肿瘤成对样品分析内容

　　somatic SNVs、somatic INDELs、somatic CNVs检测

　　somatic SNVs、somatic InDels和somatic CNVs数据库注释

家系trio样品分析内容

　　SNPs检测（proband,father,mother)

　　INDELs检测（proband,father,mother)

　　SNPs、InDels数据库注释

注释的数据库至少12种以上，如下是数据库的类型和版本。